खंडीय लेखाकार/खंडीय लेखा अधिकारी, महालेखाकार द्वारा प्रत्येक खंडीय कार्यालय में तैनात किए जाते हैं ताकि वे खंड के खातों के संबंध में खंडीय अधिकारी के दायित्वों के निर्वहन में सहायता कर सकें. खंडीय लेखा अधिकारियों/खंडीय लेखाकारों के कर्तव्य/कार्य तीन प्रकार के होते हैं: 

• लेखाकार के रूप में: निर्धारित नियमों के अनुसार और उन्हें उपलब्ध कराए गए आंकड़ों के आधार पर खंड के खातों का संकलनकर्ता.

• आंतरिक परीक्षक के रूप में: प्रारंभिक खातों, वाउचरों आदि की कुछ प्रारंभिक जाँच करने की ज़िम्मेदारी सौंपी गई.

• वित्तीय सलाहकार के रूप में: खातों और बजट अनुमानों से संबंधित सभी मामलों में, या सामान्य तौर पर वित्तीय नियमों के संचालन में खंडीय अधिकारी के सलाहकार.