महानिदेशक लेखा परीक्षा का कार्यालय, मध्य रेल भारतीय लेखापरीक्षा एवं लेखा विभाग के कार्यालयों में से एक है जो भारत के नियंत्रक और महालेखापरीक्षक (CAG) के नियंत्रण में कार्य करता है। यह भारत में 17 क्षेत्रीय(ज़ोनल) रेलवे लेखापरीक्षा कार्यालयों में से एक है। महानिदेशक लेखापरीक्षा, मध्य रेल प्रशासनिक मामलों के मामले में भारत के नियंत्रक एवं महालेखापरीक्षक के प्रति और भारत के उप / अपर उप नियंत्रक एवं महालेखापरीक्षक (डीएआई / एडीएआई) (रेलवे) के माध्यम से ऑडिट के लिए जिम्मेदार है । महानिदेशक लेखापरीक्षा, मध्य रेल का कार्यालय, निम्न के संचालन के लिए जिम्मेदार है:
• मध्य रेल (CR) के लेखाओं का लेखा परीक्षा
• कोंकण रेलवे कॉर्पोरेशन लिमिटेड (KRCL) का पूरक लेखा परीक्षा; तथा
• महाराष्ट्र रेल इन्फ्रास्ट्रक्चर डेवलपमेंट कॉरपोरेशन लिमिटेड (MRIDC) का पूरक लेखापरीक्षा
और भारत के संविधान के अनुच्छेद 151 के तहत भारतीय रेल के लेखाओं पर भारत के नियंत्रक और महालेखापरीक्षक के लेखापरीक्षा प्रतिवेदन में शामिल करने के लिए लेखा परीक्षा निष्कर्षों का संकलन।
रेल मंत्रालय के तहत सार्वजनिक क्षेत्र के उपक्रम कोंकण रेलवे कॉरपोरेशन लिमिटेड (KRCL) का लेखा परीक्षा मई 2012 के दौरान इस कार्यालय को सौंपा गया है।
महाराष्ट्र रेल इन्फ्रास्ट्रक्चर डेवलपमेंट कॉरपोरेशन लिमिटेड (MRIDC) का लेखा परीक्षा नवंबर, 2018 में इस कार्यालय को सौंपा गया है।