कार्यालय प्रधान महालेखाकार (लेखा व हक), मणिपुर निम्नलिखित के लिए जिम्मेदार है।

• 11 ट्रेजरी और 5 सब-ट्रेजरी, लोक निर्माण विभाग और वन विभाग से प्राप्त वाउचर और शेड्यूल के आधार पर व्यय और प्राप्तियों के मासिक सिविल खातों का संकलन;
• राज्य के वार्षिक विनियोग खातों और वित्त खातों की तैयारी;
• जमा खातों और आवक और जावक निपटान खातों का रखरखाव;
• उच्च न्यायालय के न्यायाधीशों, राज्य लोक सेवा आयोग के अध्यक्ष के अलावा अखिल भारतीय सेवा के अधिकारियों, राज्यपाल, मंत्रियों, विधान सभा के सदस्यों, न्यायाधीशों और राज्य न्यायालय के सदस्यों सहित राज्य सरकार के सभी राजपत्रित अधिकारियों, के वेतन और भत्ते का प्राधिकरण और अन्य सेवा रिकॉर्ड का रखरखाव;
• लेखापरीक्षा और लेखा दोनों कार्यालयों के लिए वेतन और लेखा कार्यालय;
• राजकोष / उप राजकोष का निरीक्षण।